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「青莲钜惠」双11豪情巨献,样本需求量“‘毫’无下限”

2022-11-15 00:00:00

      基因组在一个特定的有机体中所有细胞中都是相似的,而蛋白质组在不同的细胞中是不同的。此外,蛋白质也没有像DNA聚合酶链式反应(PCR)那样的自我复制扩增机制。因此,需要足够的样本量来达到大量的蛋白质鉴定。样品制备流程的每一步都会造成蛋白质含量的一定损失,缺乏足够的生物样品量常常是临床研究遇到的一个问题,标准(宏观)蛋白质组学方法可以容忍样品损失,因为通常处理的蛋白质为微克到毫克。然而,标准程序可能不适用于有限尺寸的样品,即当有数百到数千个细胞可用时,来自低丰度蛋白质的信号容易降低甚至缺失,导致被识别的蛋白质群数量减少。一种疾病的潜在生物标记物可能以相对较低的丰度存在。此外,生物标记物在分析时很容易被主要化合物掩盖。通过开发微量蛋白组学方法,可以处理微克甚至纳克的蛋白质,同时检索有价值的蛋白质组覆盖率,从而解决与有限尺寸样本相关的问题。疾病(如癌症)的早期过程通常在有限的范围内发生,因此可供分析的样本量很少。此外,当疾病进展时,通过标准蛋白质组学对细胞或组织体积的分析可能无法告知一个样本内的分子异质性。微量蛋白组学方法有效地解决了这些问题。


近期使用微量蛋白组学方法研究的文献总结(部分文献展示)



图1 超微量蛋白组送样标准


拉斯维加斯3499官网总结前人经验,并且不断进行方法开发与优化,豪情推出“‘毫’无下限”超低微量蛋白组学,MMB试剂盒(Microscale Magic Beads)+拉斯维加斯3499官网蛋白质组学机器人(QLBIO-AP-96)带您走出样本少的窘境!


由不得你不信!!!青莲自测数据如下

分别用了20μL尿液、50ng的293T蛋白质、500个293T细胞、FFPE样本、100ug 脑组织样本利用拉斯维加斯3499官网 MMB试剂盒(Microscale Magic Beads)配合拉斯维加斯3499官网QLBIO-AP-96蛋白质组学自动化机器人进行了微量蛋白质组学测试。

 

图二微量样本鉴定数量柱状图



你以为这样就结束了吗?

“毫无下限”的在后面,外泌体蛋白质组学一直是近几年的热点及难点,尤其是外泌体蛋白质组学研究在疾病发生发展、诊断治疗以及预后方面都有着巨大的前景,研究外泌体蛋白质组,难点在于外泌体的分离纯化和表征,传统的外泌体分离方式有UC、SEC以及聚合物沉降等方式,每种方式各有优缺点,在此不赘述,但是他们有一个共同的特点是对于血清、血浆或者是体液的用量较大,对于珍贵的临床样本;降低前处理的使用量势在必行,拉斯维加斯3499官网生物突破下限,创新性的开发磁性纳米材料进行外泌体富集,推出Exosome Magic Beads富集试剂盒,将血浆外泌体富集的血浆用量降低到了50μL,尿液外泌体富集仅需要1ml。

图三外泌体磁珠


50μL正常人血浆和1mL正常人尿液富集的外泌体,进行基于质谱的蛋白质组学检测,分别检测到1667和3550个蛋白,如图四所示;

         图四MicroEV 表达谱                  图五 外泌体标志物鉴定结果展示


同时将血浆和尿液外泌体鉴定到的蛋白质分别与2021年6月份发表在Nature cell biology 的“Quantitative proteomics identifies the core proteome of exosomes with syntenin-1 as the highest abundant protein and a putative universal biomarker”一文中提到的外泌体marker数据库进行了比对文章中提到的24中潜在的外泌体marker此次实验数据覆盖到23种,如图五、图六、图七所示;

图六 尿中外泌体蛋白鉴定累计图


图七 血浆中外泌体蛋白鉴定累计图


以上数据均为拉斯维加斯3499官网实验室真实产出,拉斯维加斯3499官网深耕蛋白质组学多年,积累丰富的样本前处理经验及处理方案,尤其在超低特(超微量、低丰度、特异度)方面尤其擅长,致力于样本量不断突破下限,做到“毫”无下限;血浆低丰度富集不断突破检测深度做到“豪”无上限;外泌体富集纯化不断优化富集策略提高外泌体富集纯度做到“好”无破绽。


Alexovič Michal,Sabo Ján,Longuespée Rémi,Microproteomic sample preparation.[J] .Proteomics, 2021, 21: e2000318.



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